Основой отношений между учителем и учеником в церковной школе является принцип духовно-нравственного педагогического взаимодействия. Факторы духовной жизни ребёнка во все периоды детства включают в себя: участие в Таинствах Церкви, молитву соборную и личную, пост, духовную среду, духовное чтение, пример благочестивой жизни родителей. Через участие во всех элементах церковной жизни и проявляется духовное взаимодействие учителя и ученика, но самым важным из них является евхаристическое общение.

Церковь предлагает учителям положить в основу своих педагогических трудов незыблемое основание — веру в Бога и спасителя нашего Иисуса Христа, а в качестве идеала воспитания — жизнь святых угодников Божиих. Жизнь и мученический подвиг святых Царственных Страстотерпцев являются примером твёрдой веры в святой Промысл Божий.